Факультет естественных и инженерных наук предлагает высшими учебными заведениями России и других стран сотрудничество в подготовке студентов по направлению "Физика" и родственным естественнонаучным и инженерным направлениям. 

    Кафедры факультета имеют уникальную возможность вести преподавание дисциплин специализации, таких как ядерная физика, физика элементарных частиц и др. на базе Объединенного института ядерных исследований.  Лаборатории специального физического практикума, расположенные на территории ОИЯИ,  оснащены современным оборудованием. Под руководством специалистов института студенты получают доступ к экспериментальным установкам, используемым в актуальных научных исследованиях.

В августе 2010 года было подписано соглашение о совместной подготовке бакалавров и магистров по ядерной физике между университетом «Дубна», Объединенным институтом ядерных исследований (ОИЯИ), Национальным ядерным центром Республики Казахстан и Казахским Национальный университетом им. аль-Фараби (КазНУ).

В рамках с 1 сентября 2010 г. на факультете естественных и инженерных наук проходит обучение  7 студентов-бакалавров. Четверо из них приехали из Астаны (в рамках прошлогоднего соглашения) и трое – из Алма-Аты. Ребята будут обучаться по особому учебному плану, сочетающему как совместное изучение дисциплин с российскими студентами, так и индивидуальные занятия. После годичного обучения они смогут продолжить образование в магистратуре университета, а впоследствии и в аспирантуре на базе ОИЯИ.